Pewien badacz wyznaczył struktury dwóch pokrewnych związków. Oba kryształy miały symetrię grupy przestrzennej P21/c. Następnie programem Mercury wyznaczył odpowiadające sobie kąty torsyjne pomiędzy atomami węgla i atomem odpowiedniego halogenu. W pierwszym wyszło +30 stopni, w drugim -34 stopnie. Na ile słuszny jest wniosek, że konformacja tych związków różni się nie tylko wielkością kąta torsyjnego, ale i znakiem tego kąta?
Wydaje mi się, że wiem co to znaczy “konformacja cząsteczki”, ale co oznacza termin “konformacja związku”?
Miałem na myśli “konformacja cząsteczki danego związku chemicznego” (w zadanych warunkach).
Warto zdawać sobie sprawę, że w każdej strukturze centrosymetrycznej (albo innej niechiralnej) są właściwie obecne dwie nienakładalne cząsteczki o przeciwnej konformacji. Czyli cząsteczki mają te same długości wiązań i te same kąty walencyjne, ale przeciwne co do znaku kąty torsyjne. Początkujący w badaniach strukturalnych, lub osoby nie związane z krystalografia, mogą wnioskować, że jeśli kąty torsyjne w konformacjach różnią się znakiem, to struktury krystaliczne są różne, a jest to nieprawda. Czyli właściwie w powyższym zadaniu porównywać powinniśmy nie 30 i -34 ale jeśli już to 30 i 34 (albo -30 i -34). Jest to kwestia przypadkowego wyboru jednej z cząsteczek jako części niezależnej w strukturze.